Desde la versión 3.5 de WordPress el gestor de enlaces aparece deshabiltado. Una forma sencilla de que nos aparezca de nuevo es añadir las siguientes líneas al fichero de funciones de nuestro Tema/Theme/Plantilla:

 //Añadir gestor de enlaces
 add_filter( 'pre_option_link_manager_enabled', '__return_true' );